- El Gobernador del Departamento de La Guajira, quien lo preside.
- El Ministro de Educación Nacional o su delegado.
- Un miembro designado por el Presidente de la República que haya tenido vínculos con el sector universitario.
- Un representante de las directivas académicas.
- Un representante de los docentes.
- Un representante de los egresados.
- Un representante de los estudiantes.
- Un representante del sector productivo.
- Un representante de los ex rectores.
- El Rector con voz y sin voto.
El Secretario General actúa como Secretario del Consejo con voz pero sin voto.